回购交易的主要目的是为了短期融资和资金管理。在这种交易中，一方（通常是金融机构）出售金融资产（如债券）给另一方，同时约定在未来某个时间以约定的价格回购这些资产。这种交易方式可以提供即时的资金流动性，同时保证资产的所有权在短期内回归原主。
相比之下，期货交易的目的更为多样。它既可以用于套期保值，即通过期货合约锁定未来的价格，以规避现货市场价格波动的风险；也可以用于投机，即通过预测市场价格的变动来获取利润。
回购交易的合约通常是非标准化的，即双方根据具体情况进行协商，包括回购的金额、利率、期限等。这种灵活性使得回购交易能够满足不同市场参与者的需求。
期货交易则通常是在交易所进行的，合约是标准化的。这意味着所有期货合约的条款都是相同的，包括交割日期、数量、质量等。这种标准化使得期货市场具有更高的流动性和可交易性。
回购交易的风险相对较低。由于回购交易通常涉及短期资金，市场利率的变化对交易的影响较小。回购合约的条款通常较为灵活，可以降低交易双方的风险。
期货交易的风险则较高。期货合约通常涉及较大的资金量，且合约期限较长，市场价格波动可能导致较大的损失。期货交易还需要考虑保证金要求，如果市场价格不利，交易者可能需要追加保证金，否则将面临强制平仓的风险。
回购交易的市场流动性较高。由于回购交易通常涉及短期资金，市场参与者可以较容易地找到交易对手，从而迅速完成交易。
期货交易的市场流动性则取决于合约的交割日期和市场的活跃程度。对于临近交割的合约，市场流动性可能较低，因为交易者可能更倾向于持有现货进行交割。而对于远期合约，市场流动性则可能较高，因为交易者有更多时间寻找合适的交易对手。
回购交易的结算方式通常较为简单。在交易完成时，双方按照约定的价格和利率进行资金和资产的交换。结算通常在T+0或T+1日内完成。
期货交易的结算方式则更为复杂。交易者需要在每个交易日结束时根据市场价格的变动计算盈亏，并按照保证金要求进行资金的调整。这种每日结算机制使得期货交易具有更高的风险和压力。
总结来说，回购交易和期货交易在交易目的、合约性质、风险程度、流动性和结算方式等方面存在显著差异。了解这些本质区别有助于投资者根据自己的需求和市场情况选择合适的交易方式。